Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms