Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7AQ9Y3A4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7AQ9Y3A4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7AQ9Y3A4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7AQ9Y3A4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7AQ9Y3A4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7AQ9Y3A4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7AQ9Y3A4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7AQ9Y3A4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP7AQ9Y3A4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7AQ9Y3A4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms