Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms