Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX24Q9Y343 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX24Q9Y343 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX24Q9Y343 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX24Q9Y343 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX24Q9Y343 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX24Q9Y343 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX24Q9Y343 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms