Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A6Q9Y2P4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms