Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIF3AQ9Y2N7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIF3AQ9Y2N7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms