Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-11Q9UQG0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-11Q9UQG0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms