Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA7Q9UN72 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms