Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI3Q9ULW8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI3Q9ULW8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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