Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms