Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms