Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFMBT1Q9UHJ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms