Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF1Q9UH73 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF1Q9UH73 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms