Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
IFT172Q9UG01 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IFT172Q9UG01 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IFT172Q9UG01 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IFT172Q9UG01 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IFT172Q9UG01 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IFT172Q9UG01 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IFT172Q9UG01 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
IFT172Q9UG01 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IFT172Q9UG01 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms