Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms