Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEMTQ9UBM1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEMTQ9UBM1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms