Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms