Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COPZ2Q9P299 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPZ2Q9P299 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPZ2Q9P299 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPZ2Q9P299 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPZ2Q9P299 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPZ2Q9P299 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPZ2Q9P299 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPZ2Q9P299 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPZ2Q9P299 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPZ2Q9P299 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPZ2Q9P299 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms