Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms