Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDE1Q9NZC3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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