Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TUBA8Q9NY65 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms