Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 AL355987.4-202ENST00000459985 1900 ntTSL 227.05■■□□□ 1.922e-6■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 UBE2J2-208ENST00000450390 2455 ntTSL 525.52■■□□□ 1.681e-6■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.441e-6■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 CHTF18-218ENST00000569270 711 ntTSL 523.7■■□□□ 1.382e-6■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.352e-6■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.82e-6■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 CHTF18-217ENST00000567620 701 ntTSL 518.23■□□□□ 0.512e-6■■□□□ 11.4
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AATFQ9NY61 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-6■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-6■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.1□□□□□ -1.591e-323■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 CCDC18-AS1-217ENST00000449305 748 ntTSL 218.13■□□□□ 0.493e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 CCDC18-AS1-223ENST00000457387 806 ntTSL 215.84■□□□□ 0.133e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 CCDC18-AS1-214ENST00000445076 620 ntTSL 211.17□□□□□ -0.623e-7■■□□□ 11.4
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AATFQ9NY61 CCDC18-AS1-201ENST00000411670 675 ntTSL 59.85□□□□□ -0.833e-7■■□□□ 11.4
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AATFQ9NY61 CCDC18-AS1-216ENST00000447577 431 ntTSL 57.81□□□□□ -1.163e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 CCDC18-AS1-218ENST00000450843 600 ntTSL 57.67□□□□□ -1.183e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 CCDC18-AS1-211ENST00000438777 752 ntTSL 36.72□□□□□ -1.333e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.353e-7■■□□□ 11.4
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AATFQ9NY61 RBBP6-207ENST00000564314 3361 ntTSL 29.21□□□□□ -0.932e-6■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 RBBP6-209ENST00000567686 1138 ntTSL 55.75□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 11.3
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AATFQ9NY61 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 516.53■□□□□ 0.241e-36■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-36■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -01e-36■□□□□ 11.3
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AATFQ9NY61 RPL17-214ENST00000582588 401 ntTSL 22.89□□□□□ -1.952e-38■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.532e-38■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 RBM14-207ENST00000461478 693 ntTSL 225.68■■□□□ 1.74e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.234e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.144e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.034e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.324e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.094e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 221.78■■□□□ 1.084e-7■□□□□ 11.3
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AATFQ9NY61 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 414.93□□□□□ -0.024e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.115e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.935e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.835e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.575e-7■□□□□ 11.3
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AATFQ9NY61 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.495e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.365e-7■□□□□ 11.3
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AATFQ9NY61 PYCR1-210ENST00000581271 528 ntTSL 420.44■□□□□ 0.865e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 PYCR1-206ENST00000577624 510 ntTSL 320.37■□□□□ 0.855e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 PYCR1-205ENST00000405481 841 ntTSL 218.37■□□□□ 0.535e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 PYCR1-215ENST00000585244 578 ntTSL 416.9■□□□□ 0.35e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 PYCR1-211ENST00000582198 868 ntTSL 516.84■□□□□ 0.295e-7■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 PYCR1-208ENST00000579366 681 ntTSL 313.64□□□□□ -0.235e-7■□□□□ 11.3
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AATFQ9NY61 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.785e-6■□□□□ 11.3
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AATFQ9NY61 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.412e-14■□□□□ 11.3
AATFQ9NY61 SNHG3-201ENST00000413987 2201 ntTSL 1 (best)10.41□□□□□ -0.742e-14■□□□□ 11.3
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AATFQ9NY61 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.18e-39■□□□□ 11.2
AATFQ9NY61 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 56.54□□□□□ -1.364e-28■□□□□ 11.2
AATFQ9NY61 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.074e-38■□□□□ 11.2
AATFQ9NY61 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.24e-38■□□□□ 11.2
AATFQ9NY61 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.324e-38■□□□□ 11.2
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AATFQ9NY61 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.54e-38■□□□□ 11.2
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AATFQ9NY61 ATG16L1-211ENST00000464645 560 ntTSL 410.93□□□□□ -0.664e-38■□□□□ 11.2
AATFQ9NY61 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.664e-38■□□□□ 11.2
AATFQ9NY61 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 210.55□□□□□ -0.724e-38■□□□□ 11.2
AATFQ9NY61 ATG16L1-218ENST00000498620 740 ntTSL 59.74□□□□□ -0.854e-38■□□□□ 11.2
AATFQ9NY61 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.067e-8■□□□□ 11.2
AATFQ9NY61 RPL17-210ENST00000581091 573 ntTSL 214.32□□□□□ -0.123e-43■□□□□ 11.2
AATFQ9NY61 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.593e-43■□□□□ 11.2
AATFQ9NY61 ANP32A-208ENST00000495420 707 ntTSL 221.09■□□□□ 0.976e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.596e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.396e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 517.42■□□□□ 0.386e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.336e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 UBE4B-210ENST00000488228 560 ntTSL 313.39□□□□□ -0.276e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.966e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 RPL35A-203ENST00000439255 564 ntTSL 57.2□□□□□ -1.266e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 RPL35A-204ENST00000442341 517 ntTSL 35.1□□□□□ -1.596e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 SNHG3-202ENST00000437681 2614 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.211e-34■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC9.04□□□□□ -0.961e-34■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 TCF25-207ENST00000562256 1879 ntTSL 1 (best)21.01■□□□□ 0.958e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.518e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.488e-7■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 GTF2A1-201ENST00000298173 1677 ntTSL 229.39■■■□□ 2.35e-24■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 GTF2A1-204ENST00000556268 864 ntTSL 510.93□□□□□ -0.665e-24■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.755e-24■□□□□ 11.1
AATFQ9NY61 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.15e-24■□□□□ 11.1
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