Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf109Q9NX04 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms