Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN6Q9NWW5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms