Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms