Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP7BPQ9NSQ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RRP7BPQ9NSQ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms