Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM5Q9NQX1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM5Q9NQX1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms