Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MEPEQ9NQ76 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MEPEQ9NQ76 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms