Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE7BQ9NP56 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE7BQ9NP56 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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