Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf50Q9HD87 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms