Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRMS1Q9HCU9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1Q9HCU9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1Q9HCU9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms