Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KIAA1549Q9HCM3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms