Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP29Q9HBJ7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms