Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD3Q9H7B4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms