Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C5orf42Q9H799 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms