Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
XKR8Q9H6D3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
XKR8Q9H6D3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms