Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRABDQ9H4I3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRABDQ9H4I3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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