Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD1Q9H3U5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms