Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C2

ARV1, Protein ARV1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARV1Q9H2C2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARV1Q9H2C2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARV1Q9H2C2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARV1Q9H2C2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARV1Q9H2C2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms