Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP62CLQ9H1M0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms