Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX4Q9H1E5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMX4Q9H1E5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms