Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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