Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2J2Q9GZM3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2J2Q9GZM3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms