Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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