Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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