Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP2-4Q9BYR9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms