Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HIRIP3Q9BW71 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms