Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms