Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS2Q9BVG9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms