Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF4Q9BUZ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF4Q9BUZ4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF4Q9BUZ4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF4Q9BUZ4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF4Q9BUZ4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF4Q9BUZ4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms